硒是人體必需微量元素，是人體所必需的一種微量元素，在人體器官中甲狀腺含硒量最高，主要通過含硒蛋白發揮生物學作用。硒在機體中發揮多種生物學作用，如抗氧化、提高免疫功能、抗腫瘤等。
硒參與甲狀腺激素的合成、活化及代謝過程，在甲狀腺擾氧化系統和免疫系統中發揮重要怍用。
硒對碘代謝和甲狀腺功能主要有以下幾方面重要影響：
1、抗氧化作用
甲狀腺在合成甲狀腺激素過程中會產生大量的過氧化物質，而大量的過氧化物質堆積在甲狀腺組織內,可造成甲狀腺濾泡上皮的損傷，引起諸如橋本甲狀腺炎等疾病。
硒是人體組織中最好的抗氧化劑，可以清除甲狀腺激素合成過程中產生的過多過氧化物質，從而維持甲狀腺組織氧化與抗氧化的平衡，保護甲狀腺細胞免受氧化應激損傷。
2、參與甲狀腺激素合成
甲狀腺激素主要分為甲狀腺素（T4）和三碘甲狀腺原氨酸（T3），其中T4不具有激素活性，只有通過脫碘酶的作用形成T3，而T3具有很高的激素活性。
硒參與脫碘酶T4轉化為T3的過程，缺硒可導致脫碘酶的活性降低，T4轉化為T3減少，血中T4增高，T3降低，影響甲狀腺功能發揮。
3、硒與甲狀腺自身免疫
近年來，甲狀腺疾病的發病率逐年升高，這不僅僅與環境、精神壓力、飲食結構等因素有關，免疫紊亂也在其中扮演重要角色，硒在免疫系統中具有特殊的地位，硒能有效地提高機體的免疫功能。
當低硒引起的免疫紊亂，以細胞因子介導的體液免疫為主時，產生大量甲狀腺刺激性抗體，促進甲狀腺激素合成，導致甲亢發生;
而當以細胞因子介導的細胞免疫為主時，引起甲狀腺組織淋巴細胞浸潤，釋放細胞因子并產生大量氧自由基，破壞甲狀腺濾泡細胞，表現為甲狀腺功能減退。
4、甲狀腺癌
多項流行病學證據都表明，硒攝人量與癌癥死亡率呈負相關。
研究發現，在甲狀腺癌的甲狀腺組織中，硒的含量顯著低于甲狀腺其它疾病和健康人群，提示甲狀腺中硒含量低，可能增加患甲狀腺癌的危險。其可能機制為：含硒化合物可影響瘤細胞的增殖周期及調亡；硒對細胞生化及功能也有諸多影響；此外，硒還可以影響機體的免疫功能。
綜上所述，硒對于維護人體正常機能以及甲狀腺軸的功能具有重要作用，缺硒與許多甲狀腺疾病相關。由于缺乏特異性，血清硒水平不能作為甲狀腺疾病診斷標準。鑒于大多研究都發現甲狀腺疾病患者,血清硒水平顯著低于健康人群，應考慮適當補硒。
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